Utbredd detektering av högpatogena H5 influensavirus hos vilda fåglar från Pacific Flyway i USA

Does Canada Goose Use Real Fur Online

I slutet av november 2014, var en reassortant HPAIV subtyp H5N2 med 5 gensegment liknar Sydkorea H5N8 och 3 gensegment från nordamerikanska vilda fågel AIV linjer som finns i en British Columbia, Kanada fjäderfä drift. Mellan november och december viruset spridit sig till 11 poultrylantgårdar i British Columbia och i December hittades i en vild Stjärtand (Anas acuta) i USA. På samma gång, och i nära anslutning till den positiva pintail, en H5N8 som var\u003e 99% liknar den H5N8 HPAIVs detekteras i Asien och Europa hittades i en företagsintern gyrfalcon (Falco rusticolos) som hade utfodrats med vildand meat17. Denna grupp av H5 klad 2.3.4.4 virus inklusive europeiska, ryska, koreanska, japanska, kinesiska och nordamerikanska virus har karaktäriserats som interkontinental grupp A (ICA) 9.

Denna övervakning ansträngning som började omedelbart efter rapporter om HPAIV upptäckt i British Columbia tillät tidig upptäckt av klad 2.3.4.4 virus i USA vilda fågelpopulationer. Denna snabba insatser för att samla in och testa vilda fåglar provererbjuds en unik möjlighet att bättre förstå dynamiken i ett nytt virus introduceras i ett långhus vild fågel befolkning med sin egen ände

Utbredd detektering av högpatogena H5 influensavirus hos vilda fåglar från Pacific Flyway av Förenta StatesS. N. Bevins1 n1, RJ Dusek2 n1, CL White2, T. Gidlewski1, B. Bodenstein2, KG Mansfield3, P. DeBruyn3, D. Kraege3, E. Rowan3, C. Gillin4, B. Thomas5, S. Chandler6, J. Baroch1, B. Schmit1, MJ Grady1, RS Miller7, ML Drew8, S. Stopak9, B. Zscheile10, J. Bennett11, J. Sengl11, Caroline Brady12, HS Ip2, E. Spackman13, ML Killian14, MK Torchetti14, JM Sleeman2 TJ Deliberto1Scientific rapporter 6, Artikelnummer: 28980 (2016) doi: 10.1038 / srep28980Download CitationEcological epidemiologyInfluenza virusAbstractA roman högpatogen aviär influensa tillhör H5 klad 2.3.4.4 variant virus upptäcktes i Nordamerika i slutet av 2014. Motiverad av identifiering av dessa virus i tamfjäderfä i Kanada, var en intensiv studie inletts för att genomföra övervakning högpatogen aviär influensa hos vilda fåglar i Stilla Flyway i USA. Totalt 4729 jägare skördade vilda fåglar provtogs och högpatogen aviär influensa upptäcktes i 1,3% (n = 63). Tre H5 klad 2.3.4.4 subtyper isolerades från vilda fåglar, H5N2, H5N8 och H5N1, som representerar helt eurasiska härstamning H5N8 och två nya reassortant virus. Testning av 150 ytterligare vilda fåglar under avian sjuklighet och dödlighet undersökningar i Washington gav 10 (6,7%) ytterligare högpatogena fågel isolat influensa (H5N8 = 3 och H5N2 = 7). Geografiskt utbredda detektering av dessa virus i till synes friska vilda sjöfåglar tyder på att H5 klad 2.3.4.4 variant virus kan uppträda på samma sätt i denna taxonomiska grupp där många sjöfågelarter är mottagliga för infektion men inte visar uppenbar klinisk sjukdom. Trots dessa fynd i vilda sjöfåglar har dödligheten dokumenterats för vissa vilda fågelarter och förluster i USA tamfjäderfä under första halvan av 2015 var utan motstycke.

Under hösten 2014, var H5N8 HPAIV upptäcktes i en jägare skördas bläsand (Anas Penelope) i norra Ryssland, mer än 3000km från Sydkorea, men inom den kända häckningsområde för denna species12. Strax efter denna upptäckt, var HPAIV H5N8 rapporterades antingen kommersiella fjäderfä eller vilda fågelarter i Tyskland, Nederländerna och Förenade Kingdom13,14,15. Genetiska skillnader som observerats i virus som erhållits från de europeiska utbrott, tillsammans med en brist på samband mellan de berörda lokaler, tyder på att i de flesta fall, det fanns flera introduktioner av viruset snarare än en enda inledning följt av överföring mellan farms16.

Detection Ica H5 HPAIV i till synes friska vild birds10, kombinerat med laboratoriestudier i fågelarter som visar låg morbiditet och mortalitet, förstärker den troliga rollen för vilda sjöfåglar i uppkomsten och geografiska spridningen av dessa viruses4,5,19. Vilda sjöfåglar infekterade med ICA H5-virus troligen kan förflytta dessa virus korta sträckor, och kanske till och med långa avstånd, längs migrationsvägar; Men, hur lång tid som en smittad fågel sprider ett influensavirus, som är typiskt upp till 10 14 dagar i experimentell infektion med andra gås / Guangdong / 96 härstamning isolat i ducks28,29, spelar också en roll i sannolikheten för att viruset införs via långväga migration.

Upptäckten av dessa virus på en global skala, i kombination med multipla detekteringar i både levande och döda vilda fåglar, har lett till ökad spekulation att vilda fåglar var inblandade i rörelsen av dessa ICA H5-virus mellan continents9,10,15,18,19. Efter upptäckten av HPAIV i Kanada och Washington, var en multi byrå studie inletts för att undersöka vilda fåglar i hela Pacific Flyway. Denna övervakning fokuserat på provsamling från Hunter skördas vilda fåglar i Pacific Flyway i USA i kombination med förbättrad vild fågel sjuklighet och dödlighet övervakning. Målen för detta arbete var (1) att identifiera fördelningen av den Eurasiska H5 klad 2.3.4.4 virus hos vilda fåglar i hela Pacific Flyway i USA, vilket kan underlätta fastställandet av risken dessa virus ställde till amerikanska producenter och vildfågel fågelpopulationer, och (2) för att bättre förstå vad subtyper och vad reassortant virus var närvarande i USA.

Detta arbete fokuserar på sjöfåglar eftersom de betraktas som en primär influensa A-virus reservoar, och medan dessa uppgifter tyder på att vissa sjöfågelarter inte negativt påverkas av infektioner med Eurasian H5 clade 2.3.4.4 virus, verkar det som om andra vilda arter kan drabbas av allvarliga sjuklighet och dödlighet. Den första upptäckten av Ica reassortant H5N2 hos vilda fåglar i Nordamerika erhölls under en sjöfåglar dödlighet händelse på Wiser Lake, Whatcom County, Washington; Även om orsaken till dödlighet händelse tillskrevs aspergillos med Ica H5 infektion redovisas som en sekundär finding17. Samtidig denna sjöfåglar dödlighet händelse, dog en fånge uppfödda jaktfalk från ICA H5N8 efter matas vilda bläsand från samma area17. Från december till februari, ökad sjuklighet och dödlighet testning av vilda fåglar i Washington; 150 extra sjöfåglar, andra vattenfåglar och rovfåglar testades som en del av detta arbete. Från dessa, var ICA H5 detekterades i sex waterfowl, (5 var änder från Wiser Lake, den indexplatsen och ingår den norra pintail rapporterats av Ip et al.17 och en från en Kanada gås i en andra län). Fyra rovfåglar från 4 olika länen var också positiva och representerade 11% av alla rovfåglar (n = 35) testades. Lesioner i lunga och hjärta i överensstämmelse med HPAI infektion observerades i alla fyra rovfåglar. Dödsorsaken i de fem ankor hittats döda vid indexplatsen var fast besluten att vara aspergillos med en HPAI icke dödande co-infektion. misstänks dödsorsaken i den enda kanadagås bero på HPAI, men rollen av HPAI infektionen var svåra att tolka på grund av att frysa artefakt och en co bakteriell infektion i lungorna. Andra sjuka och döda Kanada Does Canada Goose Use Real Fur Online gäss och rovfåglar som testats positiva för ICA H5-virus har rapporterats i andra stater, vilket tyder på att de kan vara bra mål för sjuklighet och dödlighet övervakning för att identifiera närvaron av ICA H5-virus.

Trots den utbredda detektion av Clade 2.3.4.4 H5-virus hos vilda fåglar på vilka prov under detta arbete, endast två kommersiella fjäderfäanläggningar infekterades i Stilla Flyway i USA under 2015, både med ICA H5N8. Åtta hobby poultryflockar också smittade i Stilla Flyway (en med ICA H5N8, resten med ICA H5N2). Detta står i kontrast till ICA H5 utbrott sett flera månader senare i kommersiella fjäderfäanläggningar i centrala och Mississippi vägarna. I juni 2015 fanns 213 ICA H5N2 utbrott i kommersiella och hobbyfjäderfä i Central- och Mississippi Flyways30,31. De mekanismer som ansvarar för de olika skala av kommersiella fjäderfä utbrott i Stilla Flyway jämfört med de andra flygvägar är i stort sett okända, även om kommersiella utbrott visade sig vara en kombination av de båda oberoende introduktioner / punktkällor tillsammans med gemensam källa eller sido spread30. Det senare skulle vara oberoende av vilda fågelinfluensan dynamik. Dessutom svarade helt Eurasian H5N8 virus för nästan 40% av HPAIVs hos vilda fåglar, men bara fyra av de 223 dokumenterade tamfågelutbrott i USA mellan december 2014 och juni 2015 orsakades av H5N830. Laboratoriestudier tyder på att dessa virus var väl anpassad till sjöfåglar värd, med experimentellt infekterade mallards återstående asymptomatiska medan lätt överföring av viruset till artfränder. Detta står i kontrast till den mindre effektiv överföring till kontakter som ses i infekterade chickens32. Dessa skillnader kan spela en roll i olika mönster ses i vilda fåglar kontra tamfjäderfä. inträffade februari maj 2015 i Mellanvästern USA, som representerar skillnader i både tid och rum och göra direkta jämförelser svåra. Mellan mars och juni 2015, amerikanska fjäderfäproducenter förlorat nästan 50 miljoner fåglar till dessa outbreaks31.

I början av 2014, Sydkorea rapporterade förekomsten av en H5 klad 2.3.4.4 HPAIV i tamfjäderfä och vilda waterfowl5. Även om H5N8-viruset var roman, H5-genen av detta virus var fast besluten att vara en ättling till den högpatogena H5N1-viruset först upptäcktes i Kina 1996 (Goose / Guangdong / 96 härstamning) 8. Mellan januari och juli 2014 H5N8 HPAIV infekterade tamfjäderfä på 212 gårdar i Republiken Korea4,8,9 och upptäcktes i ett stort antal lokala vilda fåglar (inklusive både levande och döda sjöfåglar) 10. Upptäckter hos tamfjäderfä i Kina, Japan och Taiwan followed11 snart.

DiscussionThe mål av denna övervakning skulle avgöra om eurasiska clade 2.3.4.4 virus, nyligen införda till Nordamerika, var närvarande i US Pacific Flyway vilda fågelpopulationer och i så fall bättre att förstå i vilken utsträckning de cirkulerade. Studien motiverades både den snabba spridningen av dessa H5-virus i Asien och Europa och genom att upptäcka dessa virus i Canada8,9,24. Eurasian clade 2.3.4.4 virus upptäcktes i 1,3% (63 av 4729) av jägare skördade sjöfåglar samplas i Pacific Flyway. Tre olika neuraminidassubtyper detekterades, vilka alla var en del av H5 klad 2.3.4.4 härstamning, inklusive helt eurasiska härstamning H5N8, liksom Eurasian Nordamerikanska reassortanter H5N2 och H5N1; vilka alla är\u003e 99% similar17 tvärs eurasiska gensegment till andra Ica H5 HPAIVs17,25. Den reassortant H5N2 (19/41, 46,3%), och H5N8 (19/41, 46,3%) var lika vanliga i Hunter skördade fåglar. Tre jägare skördade prov testade positivt för den reassortant H5N1 (3/41, 7,3%). H5N2 (n = 7) och H5N8 (n = 3) detekterades i prover från sjuka eller döda fåglar.

Isoleringen av flera reassortant virus hos vilda fåglar är inte förvånande med tanke på den välkända förekomsten av genetisk rekombination i influensavirus, som uppträder då mer än ett virus infekterar samma värdcell. Den segmenterade genomet hos influensavirus kan segment från olika virus som ska handlas och i det här fallet verkar införandet av eurasiska H5-virus i den nordamerikanska genen influensa pool ha genererat flera nya subtyper (eurasiska amerikansk härstamning H5N2 och H5N1) 17,25. Taiwan har också identifierat nya reassortanter efter H5 klad 2.3.4.4 virus initialt detected26. Även om det är inte förvånande att se reassortant virus, deras uppkomst i vad som tros vara en relativt kort tid är spännande. de Vries et al.11 noteras att denna framväxten av nya H5 kombinationer saknar motstycke i H5N1 evolutionära historia. I Nordamerika och på andra platser, exempelvis Kina och Taiwan17, snabb omgruppering av klad 2.3.4.4 virus kan underlättas genom möten med ett stort och vari population av LPAIVs hos vilda fåglar, även om detta mönster inte nödvändigtvis ses i Europa där föreningen av denna nya virus med vilda fågelpopulationer verkar inte ha gett upphov till liknande reassortant händelser i samma relativt kort tid.

Does Canada Goose Use Real Fur Online

IntroductionAvian influensavirus (AIV) har identifierats i mer än 100 vilda fåglar species1 och Anseriformes (ankor, gäss och svanar) och Charadriiformes (måsar, tärnor och vadare) anses vara de primära vilda reservoarer för dessa virus. Vilda fåglar infekterade med AIVs visar ofta inga tecken på klinisk sjukdom, även om detta kan variera kraftigt baserat på fågelarter och subtyp inblandade. Klassificeringen av AIVs så hög patogen eller lågpatogen baseras på dödlighet av viruset i chickens2. Högpatogen aviär influensavirus (HPAIV) orsakar ofta betydande dödlighet hos kycklingar, andra tamfåglar, och i vissa fall, vilda fågelarter, men HPAIVs inte tros bestå eller cirkulera i stor utsträckning i vild fåglar3. Lågpatogena H5 och H7 influensatyper har förmågan att utvecklas till HPAIVs som är dödlig i inhemsk poultry1,4,5,6,7 och så dessa subtyper är av särskilt intresse på grund av deras potential att orsaka storskalig avian dödlighet och ekonomiska förluster.

Intressant nog mer än hälften av de H5 detekteringar (63/113 prover, 60%), och 13% (63 av 469) av alla influensa A-detekteringar från Hunter skörd övervaknings prover var Eurasian H5 HPAIVs, vilket antyder att H5 klad 2,3. 4.4 virus var en väsentlig del av influensa A genpoolen i amerikanska vilda fågelpopulationer under vintern 2014 2015. Wild fågel influensa övervakningsinsatser som genomförs från 2006 201122,23 fann en signifikant lägre förekomst av H5-virus i vinterprov i de två vanligaste samplade arter (gräsand och bläsand) från Pacific Flyway jämfört med den nuvarande insats. Prover som tagits från amerikansk bläsand stod för nästan hälften av alla Ica H5 upptäckter (31 av 63) i vilda sjöfåglar. Amerikansk bläsand (n = 777) var de arter som oftast infekterade med ICA H5 trots gräsand vara arten mest samplade (1,410 gräsprover, 15 HPAIV upptäckter). Den höga infektion förekomsten av Ica H5-virus upptäcks under denna vilda fågel provtagning ansträngning sannolikt åtminstone delvis återspeglar införandet av ett nytt virus i långhus population av fåglar som inte hade någon tidigare exponering för klad 2.3.4.4 virus; emellertid är det okänt om dessa virus kommer att fortsätta att cirkulera på höga nivåer över tiden. I allmänhet är det tänkt att HPAIV virus inte hålls i vilda fågelpopulationer. Detta grundar sig främst på HPAIV har sällan isolerats från vilda fåglar före detta uppkomst, även om tidigare forskning har funnit H5N1 utbrott hos tamfjäderfä att nära associera med kända vilda fågelflyttning routes27. Även om detta arbete dokumenterat den utbredda förekomsten av HPAIV i vildfågelpopulationer, är möjligheten att på lång sikt uthållighet okänd. Vår förståelse av HPAIV dynamiken hos vilda fåglar i fortfarande begränsad trots en kraftig ökning av forskning om influensa under det senaste decenniet och detta understryker behovet av fortsatt och konsekvent övervakning av HPAIV dynamik hos vilda fåglar över tiden.

ResultsWild Bird SamplingFrom December 20, 2014 genom 1 Feb 2015 totalt 4729 muntlig och kloaksvabbprov var opportunistiskt in från jägare skördade fåglar. Dessa prover erhölls från 6 stater i Stilla Flyway (fig. 1, tabell 1), med 33% av prover från Kalifornien, 9% från Idaho, 9% från Nevada, 19% från Oregon, 7% från Utah, och 23% från Washington. Prov platser spreds över 45 län och nästan 100 provlokaliseringar. Sammanlagt 33 arter urvalet, varav de flesta var simänder, kända reservoarer för AIVs6,20. Dessa 469 influensa A positiva prover kom från 15 olika arter (tabell 2). Av influensa A positiva prov, 113 (medelvärde prevalens = 2,4%, 95% CL = 2,0 2,9) testade positivt för H5 av rRT PCR; 55 testade positivt för H7 (medelvärde prevalens = 1,2%, 95% CL = 0,87 1,5). Alla H7 positiva prover testas för patogenicitet (n = 35), bestämdes att vara lågpatogena virus. Av de H5 positiva prover, 63 var positiva genom molekylära analyser, inklusive en mycket specifik Eurasian H5 klad 2.3.4.4 analys (D. Suarez, opublicerad), för H5 Ica virus (genomsnittlig prevalens av 4729 sampel = 1,3%, 95% CL = 0,98 1,7). Inget virus isolerades från 22 av de 63 positiva proverna och så neuraminidas (NA) subtyp inte bestämdes. Isolat (n = 41) från de återstående positiva identifierades som H5N2 (n = 19), H5N8 (n = 19), H5N1 (n = 3). Det fanns också två möjliga blandade infektioner med en H5 klad 2.3.4.4 positiv och en LPAIV; var dock subtypen inte slutgiltigt fastställts före publicering. Arter som var HPAIV positiv var amerikansk amerikansk kricka (Anas crecca, n = 4), amerikansk wigeon (Anas americana, n = 31), Kanada gås (Branta canadensis, n = 1), snatterand (Anas strepera, n = 1), gräsand (Anas platyrhynchos, n = 15), stjärtand (n = 5), skedand (Anas clypeata, n = 3), och trä anka (Aix sponsa, n = 3) 21. Vi kan dock jämföra H5-viruset prevalensen mellan de två tidsperioder. Geological Survey National Wildlife Health Center. Fyra sjuklighet och dödlighet händelser involverade flera fåglar och svarade för 61 sjuka eller döda fåglar, inklusive 41 slaktkroppar som erhållits från indexplatsen (Wiser Lake, Whatcom County, Washington), och tre andra separata händelser med 5, 7, och 8 sjuka eller döda fåglar undersökts. Alla återstående bidrag var enskilda sjuka eller döda undersökningar fågel. Av de 150 sjuka eller döda fåglar, 41 endast hade pinnprovexemplaren. Full slaktkroppar mottogs för de återstående 109 bidrag (tabell 3). Sex av 97 sjöfågel prover (6,2%) var Ica H5 positiv (kanadagås, norra stjärtand, gräsand, amerikansk bläsand) och 4 av 35 Raptor prover var Ica positiva (11,4%). Positiva rovfågelarter ingår pilgrimsfalk (Falco peregrinus), Coopers hök (Accipiter cooperii), och röd tailed hök (Buteo jamaicensis). Inga HPAIV positiva prover identifierades från andra vattenfåglar och inga HPAIV positiva prov identifierades när endast pinnprover lämnades in. Fem av Ica H5 detekteringar gjordes i sjöfåglar hittades död på indexplatsen från de pågående sjuklighet och dödlighet event17. Dessutom hittade 4 enskilda rovfåglar döda i 4 olika Washington län (Whatcom, Skagit, Grays Harbor, och Benton), och en enda kanadagås hittades sjuk i Jefferson County, WA var Ica H5 positiv. Ingen av de enskilda rovfåglar eller enda kanadagås som testade Ica H5 positivt var förknippade med sjuklighet eller dödlighet händelser. H5N2 upptäcktes i 7 olika fåglar och H5N8 upptäcktes i 3 fåglar (tabell 4). H5N2, H5N8 och H5N1 virus samar cirkulerar i vilda fåglar som provtagits Pacific Flyway under övervakning ansträngning. Evolutionära analyser genomfördes i MEGA6 och den evolutionära historien sluta med maximum likelihood metod som bygger på Hasegawa Kishino Yano (HKY) model43,44. Trädet med högsta logg sannolikhet visas. Fetstil prover från vilda fåglar som provtagits Pacific Flyway. HA-analys involverade 85 nukleotidsekvenser, varav 42 var från prover som tagits under denna övervakning ansträngning. Evolutionära analyser genomfördes i MEGA6 och den evolutionära historien sluta med maximum likelihood metod som bygger på Hasegawa Kishino Yano (HKY) model43,44. Trädet med högsta logg sannolikhet visas. Fetstil prover från vilda fåglar som provtagits Pacific Flyway. Analys av NA-genen involverade 57 nukleotidsekvenser, varav 43 var från prover som tagits under denna övervakning ansträngning.